هاجم الإعلامي إبراهيم عيسى تواجد عدد من عناصر جماعة الإخوان المسلمين ضمن قيادات مشيخة الأزهر الشريف، منوها إلى أنه "عيب" على شيخ الأزهر أن يكون في عهده عناصر إخوانية داخل مشيخة الأزهر، فيما اعتبره تستر منه عليهم.
وقال عيسى في حلقة أمس من برنامج "25\30"، المذاع عبر فضائية "أون تي في": "أنا أحمل الرئيس السيسي والشيخ أحمد الطيب، مسئولية قيادة الأزهر شخصيًا، مسئولية قيادة الأزهر وتطهيرها من هؤلاء المتاخونين، وأنا أُشهد مصر كلها، وقبل مصر أُشهد الله، على الرئيس والإمام، الرئيس السيسي والإمام أحمد الطيب على شخصيات متأخونة إخوانية، طابور خامس، وسادس وسابع، بل ويسلمان هذه الشخصيات الأزهر، بل ويسلمان هذه الشخصيات ما يُتصور ويُزعم أنه مواجهة ومحاربة للإرهاب، وأنه في الوقت الذي تدعي وتزعم فيه الدولة أنها تحارب الإرهاب، إذا بها ترى قيادات الأزهر على هذا النحو".
وأضاف الكاتب الصحفي: "وشيخ الأزهر الذي يعلم القاصي والداني أنه مفكر ومستنير، يقود الأمر من تحته ومن أمامه ومن ورائه هذه المجموعة، التي لا يمكن أن تنكر المنسوب إليها، انتماءها، وقد كشفت وقلت عن الشيخ عباس شومان، وكيل الأزهر، الذي سمح شيخ الأزهر أن يكون على رأس لجنة إصلاح مناهج التعليم في الأزهر، وهو الرجل نفسه الأمين العام لمجمع البحوث، وهو الرجل نفسه الذي يلقي بيان محاربة الإرهاب في المؤتمر الذي عقده الأزهر، وهو أيضًا الرجل نفسه خطيب مرسي، والذي قال أن من حق مرسي ان يعصف بالقضاء، وأن يعزل خصومه، وهو نفس الرجل الذي نشر على صفحته على فيس بوك تأييدًا محمومًا لمحمد مرسي حتى إنه تحدث كجندي وراء هذا الرجل، ولعن معارضيه، وهو الشعب المصري".