اعترف تنظيم الإخوان بأخطائه خلال فترة حكم محمد مرسى وما بعدها، وكشفت مصادر إخوانية، أن محمد بديع، المرشد العام المحكوم عليه بالإعدام بعث برسالة لشباب الإخوان من محبسه عبر أحد محاميه، اعترف فيها بأخطاء مكتب الإرشاد قبل 30 يونيو، فيما كشف أحد شباب الإخوان لـ«الوطن» عن كتاب بعنوان «الرؤية البديلة: الإخوان والثورة بين العمل السياسى والحزبى»، أعده الدكتور ياسر جابر الحاج، القيادى فى تنظيم الإخوان، أستاذ جراحة العيون المفصول من جامعة الزقازيق، تضمن أولى المراجعات الفكرية والسياسية لتقييم الإخوان منذ 25 يناير 2011 حتى 2014.
 
وأشارت المصادر إلى أن «بديع» حث الشباب على الوحدة، واعترف لأول مرة بأخطاء منها «الاستهانة بحركة تمرد ودعوات التظاهر فى 30 يونيو وفشل إدارة الأزمة مع الجيش وقتها حتى اعتصام رابعة»، كما حاول المرشد احتواء الشباب، بعد تسرب أنباء بأن عقد التنظيم بدأ ينفرط.
 
ورصد كتاب «المراجعات» فشل الإخوان فى إدارة السلطة خلال فترة حكم «مرسى»، وظهورهم كمهرولين إلى كرسى الرئاسة، إضافة لتراجع شعبيتهم منذ «استفتاء مارس»، وليس كما يدعى البعض أن الإعلام هو السبب، واعترف «صاحب المراجعات» بنجاح ثورة 30 يونيو نتيجة الحصانة الشعبية التى حصل عليها الجيش ورغبة المواطنين فى إنهاء حكم الإخوان، بعيداً عن استخدام الدبابة والسلاح، وأكد «الحاج» أن حرق الجماعة فى الشارع جعلها تقف بمفردها أمام ثورة 30 يونيو دون ظهير شعبى.